牛表观组数据库

探索牛的表观组与多组学数据。

牛表观组数据库整合不同组织、品种、发育阶段和生物学条件下的公开测序数据,汇集 Run 元数据、样本与实验信息,以及标准化表观组轨道和关联多组学分析结果。

数据涵盖染色质可及性、组蛋白修饰、DNA 甲基化、三维基因组与转录表达,可按基因、基因组坐标或 Run / Experiment accession 检索,为调控元件发现、候选区域筛选及牛复杂性状研究提供数据参考。

两头牛站在蓝天与草地之间的牧场中

例如:SRR37700558;ENSBTAG00000000001;chr1:1-200000

研究项目128公开研究
实验项目436多组学实验
测序 Run2,941已整理元数据
浏览器轨道8,762ARS-UCD2.0 及旧组装
数据分布

数据库中的实验类型

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RNA-seq
142
ATAC-seq
96
ChIP-seq / CUT&Tag
118
WGBS / RRBS
42
Hi-C / 三维基因组
38
转录组染色质可及性染色质标记